L'actuelle église du Corpus Christi était l'ancienne Grande Synagogue de Ségovie. La date exacte de sa construction n'est pas connue, mais les dernières études laissent à penser qu’elle daterait du XIVe siècle. 

Il s'agit de la mieux conservée des cinq synagogues la communauté juive ségovienne, qui aurait été convertie au christianisme en 1410. 

À l'intérieur, on retrouve la symbiose entre le bâtiment juif primitif et la décoration typique de son utilisation chrétienne ultérieure. 

La salle de prière est divisée en trois nefs, séparées par des arcs en fer à cheval et des piliers surmontés de chapiteaux en forme de pommes de pin et de volutes. Les nefs latérales sont surmontées d'une galerie continue composée d'arcs en fer à cheval entrecoupés d'arcs lobés. 

Elle appartient actuellement à un couvent de religieuses Clarisses, qui en sont responsables.