La existencia de este templo consta desde mediados del siglo XII, siendo renovado a finales del mismo siglo.  El escaso número de parroquianos, dada la cercanía de la iglesia de San Nicolás y La Trinidad, motivaron una larga decadencia hasta el siglo S.XVIII en que amenazaba ruina. Después fue anejada junto con la Iglesia de Santiago a la Parroquia de San Esteban, aunque mantuvo el culto hasta mediados del s XIX.

A la segunda mitad del siglo XII, corresponde la torre, adosada al lado meridional de la cabecera y a la que se accede desde el interior de la misma.

Este templo fue salvado del estado de ruina definitivo por las restauraciones de 1927, promovidas por la Universidad Popular de Segovia. Hoy alberga la sede de la Real Academia de Historia y Arte de San Quirce, que tiene en ella su biblioteca y sala de conferencias.